Черемисиновский район состоит из 9 муниципальных образований состоящих из 99 населенных пунктов.
Муниципальное образование «поселок Черемисиново» состоит из 1 населенного пункта: п. Черемисиново.
Краснополянский сельсовет состоит из 21 населенного пункта: д. Хмелевская, д. Ефремовка, д. Ивановка, д. Становое, д. Сухой Хутор, с. Чернянка, д. Садовка, д. Безобразово, д. Бутырки, д. Камышовка, д. Карасевка, с. Новые Савины, д. Серединка, с. Старые Савины, д. Филюшкины, с. Старые Савины, д. Исаково, д. Косоржа, д. Низ, д. Сулаевка, д. Чапкино.
Михайловский сельсовет состоит из 20 населенных пунктов: с. Михайловка, д. Дурновка, д. 1-я Знаменка, д. 2-я Знаменка, д. Корсовка, д. Малиновка, д. Основное, д. Петрищево, с. Толстый Колодезь, д. Трухочевка, д. Хрущевка, д. Теплое, д. Баклановка, д. Бобровка, д. Жаровка, д. Лески, д. Муравка, д. Прилепы, д. Сенчуковка, д. Хворостянка.
Ниженский сельсовет состоит из 7 населенных пунктов: д. Мяснянкино, д. Жуково, д. Луговское, д. Мещеринка, д. Ниженка, д. Среднее Жуково, д. Среднее Общество.
Петровский сельсовет состоит из 1 населенного пункта: с. Петрово-Хутарь.
Покровский сельсовет состоит из 7 населенных пунктов: д. Сельский Рогачик, д. Алтуховка, д. Огневка, х. Подлесье, х. Толстянка, д. Удеревка, д. Чубаровка.
Русановский сельсовет состоит из 15 населенных пунктов: с. Русаново, д. Головановка, д. Головинка, д. Гореловка, д. Громовое, д. Заикинка, д. Кулига, д. Никитское, д. Плаховка, с. Нижнеольховатое, д. 2-е Бутырки, д. Волчанка, х. Дворянка, д. Картавцевы Выселки, д. Косиновка.
Стакановский сельсовет состоит из 15 населенных пунктов: с. Стаканово, д. Алексеевка, д. Баранцевские Выселки, д. 1-е Бутырки, д. Заречье, д. Москвинка, д. Новая Даниловка, д. Орлянка, д. Осиновка, с. Рындинка, д. Юдинка, с. Исаково, д. Должанка, д. Ивановка, д. Ракзинка.
Удеревский сельсовет состоит из 12 населенных пунктов: д. Удерево, д. Архангельское Уединение, д. Вышний Щигор, д. Дуровка, д. Карташовка, д. Крюково, д. Нижний Щигор, д. Парменовка, д. Ползиковка, д. Уединенное, д. Хитровка, д. Хохловка.